在临床中，男性朋友治疗尿道炎后，反复发作的也不在少数，也给身体造成了更大的伤痛。威海男科专家指出尿道炎反复发作的原因多见于致病菌耐药、免疫力（免疫力）低下、神经过敏因素、潜伏隐匿感染、潜伏隐匿感染等，因此专业系统的治疗才是科学的。
专家介绍男性尿道炎“卷土重来”的原因：
(1)致病菌耐药：当患者病发时没有得到正规有效的治疗，在用药方面存在问题、破坏内环境，使得病菌形成了耐药性，这是导致尿道炎反反复复发作的重要原因。
(2)免疫力低下：患者的免疫力不够，导致其他的病菌入侵，例如：糖尿病、肿瘤、肝病、营养不良或其他慢性疾病，对尿道炎的治疗也造成很多困难。
(3)神经过敏因素：还有些属于神经原因，是神经官能症的一种特殊表现;一些具有过敏体质的病人，抗过敏治疗获得一定疗效，说明一部分病人与变态反应有关，尿混浊，尿道痒。
(4)潜伏隐匿感染：部分微生物引起的尿道炎经抗生素治疗后，因药效和疗法的缺陷细菌将进入潜伏感染状态，在饮酒、劳累、精神紧张等因素可能诱使潜伏致病菌繁殖，从而出现症状，即尿道炎复发。
(5)并发症的影响：如若病情反复，长期炎性损害，造成尿路黏膜、肾盂肾盏受损、纤维化、变形，尿路梗阻、畸形影响了正常的尿液引流和治疗，都给尿道炎的治疗带来影响，使得传统的药物治疗疗效不佳，治疗更加困难。
(6)隐深部位的感染：由于致病菌隐藏于组织深层，埋藏在尿道深处，和尿道旁腺等隐蔽的地方，使得药物很难对其全面杀死，没有达到斩草除根的作用。同时急性尿道炎有可能伴发前列腺炎，当尿道炎治疗后，仍可因来自前列腺的感染而复发。
